Pada 2007, satu kemalangan telah berlaku di Wakaf Tuan Farrer lalu meranapkan keseluruhan struktur wakaf ini. Pihak MDPP dan agensi-agensi kerajaan telah membina semula wakaf ini bagi mengekalkan nilai sejarah tempat ini.[1]

Pada tahun 2010, wakaf ini dibina semula dengan berdasarkan rupa dan rekabentuk yang asal. Wakaf ini dibina menggunakan konkrit, berbeza dengan struktur asal yang dibina berasaskan kayu. Struktur asal seperti kayu alang dan kasa jantan masih dibina menggunakan bahan asal.[1]